针对“被员工恶意仲裁判赔付补偿金是否合法”的直接回复，需结合劳动争议相关法律依据分析：
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条，劳动仲裁委受理因经济补偿发生的争议。若仲裁裁决依据《劳动合同法》第四十六条（如单位违法解除劳动合同需支付补偿金）、第四十七条（补偿金计算标准为工作年限×月工资）等规定，且事实证据充分（如单位解除通知、员工工作年限证明），则即使员工主观有“恶意”，裁决仍合法。但若员工伪造证据（如假工资条），裁决基于虚假证据作出，则违反《劳动争议调解仲裁法》第四十九条“裁决所根据的证据是伪造的”可撤销情形，此时裁决不合法。
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处理员工仲裁主张补偿金的案件时，需注意以下特殊情况：
1. 员工仲裁时超出仲裁时效：若员工主张补偿金的时间距争议发生已超过1年（如员工离职2年后申请仲裁主张解除劳动合同补偿金），单位可提出时效抗辩，仲裁委应驳回员工请求。但需注意，若员工能证明时效中断（如离职后1年内曾向单位主张补偿金），则时效重新计算。
2. 单位已与员工达成和解协议：若单位与员工就补偿金签订和解协议（如员工离职时签订协议，单位支付5万元补偿金，员工放弃其他仲裁权利），且协议合法有效，员工再申请仲裁主张额外补偿金，仲裁委应驳回请求。但需注意，若协议存在欺诈、胁迫情形（如员工受单位威胁签订低额补偿金协议），员工可申请撤销协议并重新仲裁。
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被员工申请仲裁主张补偿金时，单位易出现以下错误操作：
1. 忽视仲裁答辩：收到仲裁通知书后未及时答辩，导致仲裁委仅依据员工证据作出裁决，即使员工主张“恶意”，单位也因未举证而败诉。
2. 证据提交不完整：仅提交部分证据（如未提交员工严重违纪的证据），无法反驳员工的补偿金主张，导致仲裁委支持员工请求。
3. 逾期申请撤销：收到不利裁决后未在15日内申请撤销，错失纠正错误裁决的机会，需强制履行赔付义务。
若您已出现上述错误操作，建议立即咨询专业劳动法律师，寻求补救措施。
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关于被员工恶意仲裁判赔付补偿金是否合法，需结合仲裁裁决的事实与法律依据判断。以下为不同情况的详细说明：
1. 若仲裁裁决所依据的事实清晰、证据充分，且符合劳动法律法规规定，则即使员工申请仲裁时主观带有“恶意”（如夸大损失），该赔付补偿金的裁决仍合法。
2. 若仲裁裁决存在事实认定错误（如误将非单位责任认定为单位责任）或法律适用错误（如错误计算补偿金标准），则该赔付裁决可能不合法，单位可通过诉讼撤销。
3. 若员工申请仲裁时伪造证据、虚构事实（如伪造劳动合同主张补偿金），且仲裁委据此作出赔付裁决，该裁决因基础事实虚假而不合法，单位可申请撤销并追究员工法律责任。

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